从水质方面看，黑臭水体的耗氧物COD、BOD和氨氮含量较高，导致水体严重缺氧；水中的气味是由于厌氧菌在转化水中的有机污染物时产生大量的气体污染物，如硫化氢、硫醇、氨和胺。水的黑化主要是由于甲烷、硫化氢等气体在沉积物中的难溶性气体上升时将污泥带入水中或水吸附金属硫化物的悬浮颗粒，如黑色FeS和MnS。

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